MINIGUIDE DE MICROBIOLOGIE

Légende:

Délai d’acheminement = Délai recommandé entre le prélèvement et la réception de l’échantillon au laboratoire	Transport différé ? = Délai toléré pour l’acheminement d’un échantillon
Exécution = Délai d’exécution de l’examen	Délai de rendu = Délai moyen de rendu du résultat ( U = en urgence)
Délai d’ajout = Délai maximum toléré pour ajouter et réaliser l’analyse par rapport à l’heure de prélèvement (NA = Non Applicable)	Liste des analyses urgentes =  liste des examens urgents validés par le technicien en permanence de soins

Conservation au labo = Donnée indicative de conservation de l’échantillon au labo (Ce délai de conservation ne signifie pas forcément l’ajout possible d’une analyse, mais il permet un contrôle d’identification des échantillons après réalisation si nécessaire)

Pour toute demande d’examens de Microbiologie, compléter sur le bon HC2-ENR009 : le motif de l’analyse, les divers renseignements s’il y a un traitement antibiotique en cours Mini Guide de Microbiologie validé par le biologiste:  Microbiologie : Dr Hilmoine   /   Biologie moléculaire : Dr Benchikh

Nature du prélèvement

Examens biologiques

Recueil

Quantité

Recommandations

Condition / Délai d’acheminement

Conservation si transport différé

Technique de réalisation / Automate

Fréquence d’exécution

Délai de rendu        et (U)

Délai d’ajout de l’analyse

Liste des analyses urgentes

Conservation des échantillons

Secteur / Activité

BIOLOGIE MOLECULAIRE

Antigène VRS par PCR

///​

Prélèvement nasal – Ecouvillon + milieu UTM rouge​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

PCR en temps réel sur Cobas Liat Roche

Tous les jours​

J0​(U < 4h)

///​

OUI​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

BIOLOGIE MOLECULAIRE

Antigène Grippe A et B par PCR

///​

Prélèvement nasal – Ecouvillon + milieu UTM rouge​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

PCR en temps réel sur Cobas Liat Roche

Tous les jours​

J0​(U < 4h)

///​

OUI​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

BIOLOGIE MOLECULAIRE

Herpès par PCR

///​

1 pot stérile rouge (LCR, liquide de ponction) Ecouvillon + milieu UTM rouge (pvt vaginal, urétral)1 tube EDTA sur sangPréciser la localisation (obligatoire)

< à 2h à T° ambiante (pot, EDTA)< à 24h à T° ambiante (UTM)​

pas d’envoi différé (pot, EDTA)< à 24h à T° ambiante (UTM)​

PCR temps réel , coffret clonit – Applied Biosystems 7500 fast​

2 fois / semaine​

< à 4 jours​

///​

NON​

1 an à -18°C​

Biologie moléculaire​

BIOLOGIE MOLECULAIRE

Chlamydiae trachomatis par PCR

///​

1 pot stérile rouge (urines 1er jet) Ecouvillon + milieu UTM rouge (pvt vaginal, urétral)Préciser la localisation (obligatoire)

< à 2h à T° ambiante (pot)< à 24h à T° ambiante (UTM)​

pas d’envoi différé (pot)< à 24h à T° ambiante (UTM)​

PCR temps réel, coffret FTD urethritis – Applied Biosystems 7500 fast​

2 fois / semaine​

< à 4 jours​

///​

NON​

1 an à -18°C​

Biologie moléculaire​

BIOLOGIE MOLECULAIRE

Gononoque par PCR

///​

1 pot stérile rouge (urines 1er jet) Ecouvillon + milieu UTM rouge (pvt vaginal, urétral)Préciser la localisation (obligatoire)

< à 2h à T° ambiante (pot)< à 24h à T° ambiante (UTM)​

pas d’envoi différé (pot)< à 24h à T° ambiante (UTM)

PCR temps réel, coffret FTD urethritis – Applied Biosystems 7500 fast​

2 fois / semaine​

< à 4 jours​

///​

NON​

1 an à -18°C​

Biologie moléculaire​

BIOLOGIE MOLECULAIRE

Mycoplasme genitalium par PCR

///​

1 pot stérile rouge (urines 1er jet)Ecouvillon + milieu UTM rouge (pvt vaginal, urétral)Préciser la localisation (obligatoire)​

< à 2h à T° ambiante (pot)< à 24h à T° ambiante (UTM)

Pas d’envoi différé (pot)< à 24h à T° ambiante (UTM)​

PCR temps réel, coffret FTD urethritis – Applied Biosystems 7500 fast​

2 fois / semaine​

< à 4 jours​

///​

NON​

1 an à -18°C​

Biologie moléculaire​

BIOLOGIE MOLECULAIRE

Coqueluche par PCR

///​

1 flacon stérile rouge (aspiration  nasopharyngée)Ecouvillon + milieu UTMrouge (Pvt nasopharyngé)​

< à 2h à T° ambiante (pot)< à 24h à T° ambiante (UTM)​

Pas d’envoi différé (pot)< à 24h à T° ambiante (UTM)​

PCR temps réel, coffret eurobio – Applied Biosystems 7500 fast​

2 fois / semaine​

< à 4 jours​

///​

NON​

1 an à -18°C​

Biologie moléculaire​

BIOLOGIE MOLECULAIRE

COVID-19 par PCR

​///

​1 pot stérile rouge (expectoration, aspiration nasopharyngée)Ecouvillon + milieu UTM rouge (Pvt nasopharyngé)

< à 2h à T° ambiante (pot)< à 24h à T° ambiante (UTM)​

pas d’envoi différé (pot)< à 24h à T° ambiante (UTM)

​PCR temps réel, coffret Viasure – Applied Biosystems 7500 fast​

​en fonction des demandes

​< à 2 jours​

​///

​NON

​1 an à -18°C​

Biologie moléculaire​

CATHETER

Cathéter veineux central

///​

1 flacon stérile rougePréciser la date de mise en place du cathéter et s’il y a des signes inflammatoires locaux​

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

CATHETER

Cathéter artériel

///​

1 pot stérile rougePréciser la date de mise en place du cathéter et s’il y a des signes inflammatoires locaux​

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

CATHETER

Cathéter périphérique

///​

1 pot stérile rougePréciser la date de mise en place du cathéter et s’il y a des signes inflammatoires locaux​

< à 2h à T° ambiante​

pas d’envoi différé​

Culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

DEPISTAGE/PORTAGE

Streptocoque B en suivi de grossesse

///​

Prélèvement vaginal – Ecouvillon + milieu eSwab roseDépistage spécifique de streptocoque B, sans bactériologie standard​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

DEPISTAGE/PORTAGE

SARM

///​

Prélèvement nasal – Ecouvillon + milieu eSwab rose​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

DEPISTAGE/PORTAGE

Staph. Aureus pré-opératoire

///​

Prélèvement nasal – Ecouvillon + milieu eSwab rose​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

DEPISTAGE/PORTAGE

EBLSE – EPC                         et autres BMR

///​

Prélèvement rectal – Ecouvillon + milieu eSwab rose​

< à 24 à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct  / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

DEPISTAGE/PORTAGE

ERG

///​

Prélèvement rectal – Ecouvillon + milieu eSwab rose​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

DEPISTAGE/PORTAGE

Portage EPC                      (patient connu ou contact)

​///

​Prélèvement rectal – Ecouvillon + milieu eSwab rose​

​< à 24h à T° ambiante

​< à 48h à 4-8°C

​Examen direct / culture​

​Tous les jours​

​< à 5 jours

​///

​NON

​7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

HEMOCULTURES

Hémocultures sang / liquide

Recommandé : 8-10 ml / Minimum : 5 ml​

Série de 2 flacons: 1 flacon aérobie à pastille verte et 1 flacon anaérobie à pastille orangePrélèvement unique : soit 4 flacons, soit 6 flaconsPrélèvements multiples : 2 flaconsPréciser le n° de la série d’hémoculture, la température du patient ainsi que le type de prélèvement (périphérique ou PAC)​

< à 2h à T° ambiante(ne pas réfrigérer)​

Pas d’envoi différé​

Biomérieux Virtuo / culture​

Tous les jours​

si négatif : 5 jours (sauf recherche spécifique 10-15 jours)si positif : 3-10 jours (U = résultat partiel < à 2h)​

///​

OUI pour hémoculture positive ​

///​

Microbiologie-Bactériologie​

HEMOCULTURES

Hémoculture pédiatrique

Recommandé : 1-3 ml​

1 seul flacon à pastille jaunePréciser le n° de la série d’hémoculture, la température du patient

< à 2h à T° ambiante(ne pas réfrigérer)​

Pas d’envoi différé​

Biomérieux Virtuo / culture​

Tous les jours​

si négatif : 5 jours (sauf recherche spécifique 10-15 jours)si positif : 3-10 jours (U = résultat partiel < à 2h)

///​

OUI pour hémoculture positive​

///​

Microbiologie-Bactériologie​

INFECTIONS OSTEO-ARTICULAIRES

Prélèvement per-opératoire

///​

Flacons stériles rouge numérotés ou Ecouvillon + milieu eSwab rosePréciser le type de prélèvement (solide, liquide)

< à 2h à T° ambiante(pot)< à 24h à T° ambiante(eSwab)​

Pas d’envoi différé (pot)< 24h à T° ambiante (eSwab)​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

15-20 jours​

///​

NON​

4 mois à -80°C

Microbiologie-Bactériologie​

INFECTIONS OSTEO-ARTICULAIRES

Matériel implanté

///

1 pot stérile rougePréciser la localisation (obligatoire) et le type de matériel (clou, vis…)

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

15-20 jours​

///​

NON​

4 mois à -80°C

Microbiologie-Bactériologie​

INFECTIONS OSTEO-ARTICULAIRES

Liquide de drainage

///​

1 flacon stérile rougePréciser la localisation (obligatoire)​

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

15-20 jours​

///​

NON​

4 mois à -80°C

Microbiologie-Bactériologie​

LCR

Liquide céphalo-                    rachidien (LCR)

Adulte : 2 à 5 mlEnfant : 2 ml​

3 à 4 pots stériles rouge numérotésdans l’ordre du recueil.Préciser sur le bon de demande les analyses souhaitées: cytologie, chimie, bactériologie, recherche d’antigènes ainsi que les renseignements cliniques (purpura, etc…)

Immédiatement à T° ambiante(ne jamais réfrigérer)​

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​(U = Résultats microscopiques < à 1h)

///​

OUI​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

LCR

Antigène pneumocoque LCR

Adulte : 2 à 5 mlEnfant : 2 ml​

1 pot stérile rouge​

Immédiatementà T° ambiante(ne jamais réfrigérer)​

Pas d’envoi différé​

Test Binax now​

Tous les jours​

J0​(U < à 1h)

///​

OUI​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

LIQUIDE ARTICULAIRE

Liquide articulaire

3 à 5 ml​

Cytologie :1 tube citratéRecherche de cristaux :1 pot stérile rougeBactériologie :1 pot stérile rouge + flacons hémoculturePréciser la localisation (obligatoire), ainsi que les demandes d’analyse : cytologie, recherche de cristaux, bactériologie

< à 1h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé

Examen direct / culture​

Tous les jours​

15-20 jours​

///​

NON​

4 mois à -80°C

Microbiologie-Bactériologie​

LIQUIDES

Pleural

3 à 5 ml​

Cytologie :1 tube citratéChimie :1 tube secBactériologie : 1 pot stérile rouge + flacons hémoculturePréciser sur le bon les analyses souhaitées: cytologie, chimie, bactériologie​

Cytologie: < à 24h à 4-8°CBactériologie: < à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé

Examen direct / culture​

Tous les jours​

7-10 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

LIQUIDES

Ascite

3 à 5 ml​

Cytologie :1 tube citratéChimie :1 tube secBactériologie : 1 pot stérile rouge + flacons hémoculturePréciser sur le bon les analyses souhaitées: cytologie, chimie, bactériologie​

Cytologie: < à 24h à 4-8°CBactériologie: < à 2h à T° ambiante

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

7-10 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

LIQUIDES

Péricardique

3 à 5 ml​

Cytologie :1 tube citratéChimie :1 tube secBactériologie :1 pot rouge stérile + flacons hémoculturePréciser sur le bon les analyses souhaitées: cytologie, chimie, bactériologie​

Cytologie: < à 24h à 4-8°CBactériologie: < à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé

Examen direct / culture​

Tous les jours​

7-10 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

LIQUIDES

Péritonéal

3 à 5 ml​

1 flacon stérile rouge

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

7-10 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

MYCOLOGIE

Mycologie

///

Ecouvillon + milieu eSwab rosePréciser la nature du prélèvement et sa localisation (obligatoire)Compléter les renseignements cliniques (contact animal, séjour à l’étranger,etc…)

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

environ 3 semaines

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Mycologie​

MYCOLOGIE PEAU/PHANERES

Peau, plis, ongles,         cheveux, poils

///​

1 pot stérile rouge ou Ecouvillon sec sans milieu de transportPréciser le type de prélèvement (peau, plis, etc…)Compléter les renseignements cliniques (contact animal, séjour à l’étranger,etc…)

< à 2h à T° ambiante

Pas d’envoi différé

Examen direct / culture​

Tous les jours​, conservation 72h à T° amb si échantillon non traité

environ 3 semaines

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Mycologie​

NEONATAL

Gastrique

///​

1 tube piègePréciser l’identité de la mère et si elle est porteuse de streptocoque B en cochant “(STB) Mère strepto B+”​

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​(U = résultat partiel < à 4h)

///​

OUIsi demandé en urgence uniquement​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

NEONATAL

Placenta

///​

1 pot stérile rouge​

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

OUI si demandé en urgence uniquement​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

OPHTALMOLOGIE

Oeil

///​

Ecouvillon + milieu eSwab orangePréciser les renseignements renseignements (conjonctivite, kératite, etc…)​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

OPHTALMOLOGIE

Collection oculaire

///​

Ecouvillon + milieu eSwab orange​Préciser les renseignements renseignements (conjonctivite, kératite, etc…)​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

PUS-Lésions cutanées

Lésion, plaie,furoncle,    escarre, ulcère,      morsure,               brûlure,            pied diabètique…

///​

1 pot stérile rouge ou Ecouvillon + milieu eSwab rosePréciser le type de prélèvement et la localisation (obligatoire): escarre, ulcère, etc…​

< à 2h à T° ambiante (pot)< à 24h à T° ambiante (eSwab)

Pas d’envoi différé (pot)< à 48h à 4-8°C (eSwab)​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 8 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

PUS-Prélèvements profonds

Biopsie, liquide de drain…

///​

1 pot stérile rouge ou Ecouvillon + milieu eSwab rosePréciser le type de prélèvement et la localisation (obligatoire): biopsie, liquide de drain, etc…

< à 2h à T° ambiante (pot)< à 24h à T° ambiante (eSwab)​

Pas d’envoi différé (pot)< à 48h à 4-8°C (eSwab)​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 8 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

SANG

Parasitologie du sang

///​

1 tube EDTALe prélèvement est réalisé en urgence en cas de fièvre ou à l’acmé d’un pic fébrilePréciser les renseignements cliniques (séjour à l’étranger, pays visités) ainsi que le traitement antiparasitaire en cours ​

< à 1h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Microscopie sur frottis, goutte épaisse et test de dépistage​

Tous les jours​

J0(U = résultat partiel < à 2h)

///​

OUI​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Parasitologie​

SELLES

Bactériologie (coproculture)

///​

1 flacon stérile rouge pour les sellesPréciser les renseignements cliniques (toxi-infection, séjour à l’étranger, etc…)​

< à 2h à T° ambiante​

< à 12h à 4-8°C​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

SELLES

Recherche de sang

///​

1 flacon stérile rouge pour les sellesLe prélèvement ne doit pas être effectué pendant la période des règles ou si le patient souffre de saignement hémorroïdal ou urinaire

< à 2h à T° ambiante​

< à 12h à 4-8°C​

Test immunochromatographique​

Tous les jours​

J0​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

SELLES

Recherche d’antigènes Cryptosporidium            -Giardia                       -Entamoeba (CGE)

///​

1 pot stérile rouge pour les sellesSi recherche d’autres parasites dans les selles, voir le bon de sous traitance HC2-ENR003

< à 2h à T° ambiante​

< à 12h à 4-8°C

Test immunochromatographique

Tous les jours

J0

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Parasitologie​

SELLES

Recherche de rotavirus

///​

1 pot stérile rouge pour les selles​

Transport rapide​

< à 12h à 4-8°C​

Test immunochromatographique​

Du lundi au vendredi : 8-16hLe week end : 8-12h​

< à 2 jours​(U < 4h)

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

SELLES

Recherche d’adénovirus

///​

1 pot stérile rouge pour les selles​

Transport rapide​

< à 12h à 4-8°C​

Test immunochromatographique​

Du lundi au vendredi : 8-16hLe week end : 8-12h

< à 2 jours​(U < 4h)

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

SELLES

Recherche de norovirus

///​

1 pot stérile rouge pour les selles​

Transport rapide​

< à 12h à 4-8°C​

Test immunoenzymatique​

Du lundi au vendredi : 8-16hLe week end : 8-12h​

< à 2 jours​(U < 4h)

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

SELLES

Recherche de                      clostridium difficile

///​

1 pot stérile rouge pour les selles​Préciser les renseignements cliniques (toxi-infection, séjour à l’étranger, etc…)La recherche de Clostridium difficile  s’effectue dans le cadre d’une diarrhée ( selles prenant la forme du pot) , chez les patients d’âge supérieur à 3 ans)

< à 2h à T° ambiante​

< à 12h à 4-8°C​

Culture + GDH + toxines​

Du lundi au vendredi : 8-16hLe week end : 8-12h​

< à 2 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

URINES

ECBU

​> à 3ml

​1 tube avec additif (boraté) kaki : recommandéRespecter le volume de remplissage du tubePréciser le type de recueil (miction, sondage à demeure, etc…)

​< à 8h à T° ambiante

​Pas d’envoi différé

​Beckman-IQ200 et culture

​Tous les jours

​< à 5 jours(U = résultat cytologique partiel < 4h pour enfant <3ans, femme enceinte,suspicion pyélonéphrite)

​///

​NON

​7 jours à 4-8°C

Microbiologie-Bactériologie​

URINES

ECBU

///​

1 tube sans additif beigePréciser le type de recueil (miction, sondage à demeure, etc…)

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Beckman-IQ200 et culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

URINES

ECBU

///

1 pot stérile rougePréciser le type de recueil (miction, sondage à demeure, etc…)

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Beckman-IQ200 et culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

URINES

ECBU

///​

1 pot de recueil bleu​ : à éviter

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Beckman-IQ200 et culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C

Microbiologie-Bactériologie​

URINES

ECBU

///​

1 tube sec rouge : à proscrire​

Examen annulé systématiquement​

///​

///​

///​

///​

///​

///​

///​

Microbiologie-Bactériologie​

URINES

Compted’Addis – HLM

> à 3 ml, transférer dans le tube boraté​

1 tube avec additif (boraté) kaki : recommandéNoter sur le bon de demande le volume des 3h​

< à 8h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Beckman-IQ200​

Tous les jours​

J0​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

URINES

Cytologie urinaire (culot)

> à 3 ml​

1 tube avec additif (boraté) kaki : recommandé​

< à 8h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Beckman-IQ200​

Tous les jours​

J0​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

URINES

Antigène legionella pneumophilia 1

///​

1 tube sans additif beige ou1 pot stérile rouge​ [ou 1 tube avec additif (boraté) kaki]

< à 24h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Test Binax now​

Tous les jours​

J0​(U < à 4h)

< à 24h​

OUI​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

URINES

Antigène               pneumocoque

///​

1 tube sans additif beigeou1 pot stérile rouge​ [ou 1 tube avec additif (boraté) kaki]

< à 24h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Test Binax now​

Tous les jours​

J0​(U < à 4h)

< à 24h​

OUI​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES GENITALES

Vagin

///​

Ecouvillon + milieu eSwab roseRenseigner les renseignements cliniques.Si recherche de streptocoque B en plus de la bactériologie, cocher “(GRO) suivi de grossesse”Si recherche de trichomonas, cocher ” (TRV) Trichomonas”

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES GENITALES

Endocol

///​

Ecouvillon + milieu eSwab roseRenseigner les renseignements cliniques.Si recherche de streptocoque B en plus de la bactériologie, cocher “(GRO) suivi de grossesse”Si recherche de trichomonas, cocher ” (TRV) Trichomonas”

< à 24 à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES GENITALES

Lochies

///​

Ecouvillon + milieu eSwab roseRenseigner les renseignements cliniques.Si recherche de streptocoque B en plus de la bactériologie, cocher “(GRO) suivi de grossesse”Si recherche de trichomonas, cocher ” (TRV) Trichomonas”

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES GENITALES

Urètre

///​

Ecouvillon + milieu eSwab orange​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES GENITALES

Dispositif intra-utérin (DIU)

///​

1 pot stérile rouge​

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES GENITALES

Liquide amniotique

///​

1 flacon stérile rouge ou 1 tube piège​

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES GENITALES

Per-opératoire

///​

Ecouvillon + milieu eSwab rose​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES GENITALES

Recherche de        trichomonas

///​

Ecouvillon + milieu eSwab rose​

< à 24h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Examen direct​

Tous les jours​

J0​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES GENITALES

Recherche de        mycoplasmes

///​

Ecouvillon + milieu UTM rouge

< à 24h à T° ambiante​

< à 24h à 4-8°C

Culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES INFERIEURES

Expectoration

> à 2 ml​

1 pot stérile rougeEviter les sécrétions salivairesPréciser si bactériologie et/ou mycologie ainsi que les renseignements cliniques liés à l’examen (pneumopathie, abcédation, etc…)Cocher les recherches complémentaires si nécessaire (nocardia, actinomycètes)

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES INFERIEURES

Aspiration endobronchique/  endotrachéale

> à 2 ml​

1 flacon piège​Préciser si bactériologie et/ou mycologie ainsi que les renseignements cliniques liés à l’examen (pneumopathie, abcédation, etc…)Cocher les recherches complémentaires si nécessaire (nocardia, actinomycètes)

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​(environ 3 semaines si demande de mycologie associée)

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES INFERIEURES

Liquide broncho-alvéolaire (LBA) et Brossage          distal protégé

> à 2 ml​

1 pot stérile rougePréciser si bactériologie et/ou mycologie ainsi que les renseignements cliniques liés à l’examen (pneumopathie, abcédation, etc…)Cocher les recherches complémentaires si nécessaire (nocardia, actinomycètes)​

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​(environ 3 semaines si demande de mycologie associée)

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES INFERIEURES

Recherche de nocardia

> à 2 ml​

1 pot stérile rouge​

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Culture​

Tous les jours​

< à 21 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES INFERIEURES

Recherche d’actinomycètes

> à 2 ml​

1 pot stérile rouge​

< à 2h à T° ambiante​

Pas d’envoi différé​

Culture​

Tous les jours​

< à 7 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES SUPERIEURES

Oreille

///

Ecouvillon + milieu eSwab orangePréciser si bactériologie et/ou mycologie ainsi que les renseignements cliniques (otite, sinusite, etc…)

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​(environ 2 semaines si demande de mycologie associée)

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES SUPERIEURES

Bouche

///​

Ecouvillon + milieu eSwab rosePréciser si bactériologie et/ou mycologie ainsi que les renseignements cliniques (angine, muguet, etc…)​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C​

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES SUPERIEURES

Gorge

///​

Ecouvillon + milieu eSwab rosePréciser si bactériologie et/ou mycologie ainsi que les renseignements cliniques (angine, muguet, etc…)​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES SUPERIEURES

Nez

///​

Ecouvillon + milieu eSwab rosePréciser si bactériologie et/ou mycologie ainsi que les renseignements cliniques (sinusite, angine, etc…)​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES SUPERIEURES

Collection ORL

///​

Ecouvillon + milieu eSwab rosePréciser si bactériologie et/ou mycologie ainsi que les renseignements cliniques (otite, sinusite, post-pératoire, etc…)​

< à 24h à T° ambiante​

< à 48h à 4-8°C

Examen direct / culture​

Tous les jours​

< à 5 jours​

///​

NON​

7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​

VOIES RESPIRATOIRES SUPERIEURES

Sinus

​///

​Ecouvillon + milieu eSwab orangePréciser si bactériologie et/ou mycologie ainsi que les renseignements cliniques (otite, sinusite, etc…)

< à 24h à T° ambiante​

​< à 48h à 4-8°C

​Examen direct / culture​

​Tous les jours​

​< à 5 jours​(environ 2 semaines si demande de mycologie associée)

​///

​NON

​7 jours à 4-8°C​

Microbiologie-Bactériologie​